Saison 3 (2006 - 2007)

Encore en deuil début septembre 2006, Charles est approché par le général Castelli, oncle du capitaine Léo, afin de transférer de l'argent en Suisse, ce qui éveille la curiosité de Frémont. Le vieil homme meurt et Charles cherche, comme beaucoup, à mettre la main sur l’héritage de Victor Castelli, plus d'un million d'euros ! L'héritage est également convoité par le dangereux docteur Livia, qui fait son retour au Mistral avec l'aide d'une taupe, Aude. Charles aidera finalement la police à arrêter Livia.

Fin 2006, la nouvelle secrétaire de Phénicie, Sophie Libourne, éveille ses soupçons et le pousse à se renseigner sur elle lorsque celle-ci veut qu'il lui fournisse un faux passeport au nom de Nathan Leserman. Charles mène son enquête grâce aux nombreux contacts qu'il a encore. On découvrira plus tard que la femme, en réalité Hélène Cantorel, était une dangereuse manipulatrice prête à tout pour sauver sa fille Estelle (cousine de Nathan).

Quelques mois plus tard, début 2007, sa fille Céline vivant alors en couple avec Vincent, prend Louis Barrel comme amant. Lors d'une dispute, Céline fait tomber Louis, qui perd connaissance. Céline appelle son père Charles à la rescousse. Charles et Céline trouvent alors Louis mort ; Charles aide Céline à se débarrasser du cadavre. Plus tard, quand Céline est soupçonnée d'avoir tué Louis, Charles dissimule les vêtements ensanglantés de ce dernier dans le domicile de Vincent ; il parvient ainsi à faire croire à la police que c'est Vincent qui a tué Louis. Une fois Vincent incarcéré, Charles reprend sa place à Phénicie.

Charles Frémont vient en aide à Luna quand celle-ci est confrontée à Lorraine Fournier et Samuel Tablonka, un duo d'arnaqueurs responsables de l'incarcération de son compagnon Guillaume. Ainsi, Frémont va rencontrer Lorraine et Samuel en se faisant passer pour un client naïf ayant une grosse somme d’argent à investir. Grâce à Frémont, les deux arnaqueurs sont arrêtés par la police.

Afin d'obtenir le marché du terminal de l'aéroport de Marignane, Charles fait appel à Léonard Vassago en mai 2007, un homme d'affaires hautement influent. Vassago accepte de l'aider, mais en échange, Charles doit lui céder la moitié des parts de Phénicie. Finalement, Charles refuse de payer sa dette envers Vassago, qui cherche en représailles à détruire la famille Frémont. Ainsi, Vassago commandite le meurtre d'Aurélie, la maîtresse de Vincent Chaumette, et fait en sorte que Céline Frémont soit accusée à tort de meurtre et emprisonnée. Il manipule aussi Juliette qui tombe dans la drogue. Doté de pouvoirs démoniaques, Vassago va également faire en sorte que Charles soit victime d'hallucinations et interné en hôpital psychiatrique. Les malheurs de la famille Frémont ne seront résolus qu'avec l'aide de Luna, qui parvient à mettre Vassago hors d'état de nuire.